不过高耸的神殿只是控制中心暴露在地表的部分结构，一座行星要塞当然不能把自己的要害中枢安置在地表这么容易遭受打击的地方——在神殿之下，是深达数百公里的竖井以及一层层的装甲护壁，穿过这些厚重到丧心病狂的防护层之后才能抵达导航计算机真正所处的位置。
古老的输送系统早已因地层错位和能源离线而无法使用，但由于这种要害重地有着多套互相补充的备用系统，因此通往控制中心的照明竟然还有少数残留——从竖井向下望去，断断续续的微弱灯光就好像蜿蜒的萤火虫般一直延伸到最深层的黑暗之中，令人望而却步。
薇薇安张开了自己的蝠翼，和郝仁一起向着竖井深处飞去，而三只小妖精则飞在他们前方带路。妖精身上自带的微光有效补充了那些缺乏灯光的路段的照明，让郝仁和薇薇安这两个自带夜视的人可以清楚地看到周围细节。
竖井大部分还保持着完整，但中间仍有很多断裂歪斜的迹象，在一些错位最严重的路段，整个竖井甚至整体断裂开来并向旁边侧移了上百米，挤压进来的岩石几乎将通道拦腰截断，只留下一些窄小的裂隙和孔洞可以让妖精们通过。平常妖精可以通过这些裂缝前往控制中心的深处，但郝仁显然不行，所以在很多时候他不得不用切割光束开一条路出来。
穿过深邃的垂直通道之后，他们顺利地进入了行星战舰纳克达尔的控制中心：一间六棱柱状的大厅。
“这里就是控制中心啦！”长发小妖精在郝仁面前飞来飞去地介绍着，语气中似乎颇为自豪，“以前这里可是个超级热闹的地方，守护巨人们就在这里控制整个要塞和敌人战斗，还有很多妖精在这里帮忙调整设备状态什么的。”
“但是现在它派不上用场啦。”“哪怕修好了这里，纳克达尔也没法继续飞，毕竟引擎没了嘛。”“主动力炉也没了……”“武器系统也没啦！”“但是我们偶尔还是会来这里哦，聚会什么的。”
控制中心内一片死寂，曾经嗡嗡作响的设备运转声和人来人往的热闹劲儿都已经不再，但从这间大厅的规模和那些专为守护巨人准备的庞大设备上，郝仁仍然可以依稀想象到这里曾经是个多么恢弘而繁忙的地方。六边形的大厅里有着若干高低不一的平台，每个平台的规模都足以在其上建起一座房屋，而这些平台上还可以看到足有六七米高的操控装置和同样比例巨大的座椅：整个大厅就仿佛童话故事中的巨人王国一般，而事实上……这里确实是为巨人准备的。
守护巨人的平均身高达到十米以上，他们所使用的设施能有多大规模可想而知。
在纳克达尔遭遇的大毁灭中，曾经在这里作战的守护巨人全部战死，但妖精们却由于自身独特的生命形式，依靠和要塞里的水晶融合而逃过了那个最恐怖的瞬间。在后来的几千年里，妖精们收集了大陆上各处的巨人遗体并将他们安葬在草原上，这处控制中心里的巨人遗体当然也不例外。
在安葬了巨人们之后，妖精便很少回到控制中心，因为这里空空荡荡什么都没有，远不如地表那个至少仍然有青山绿水的世界更吸引他们。但在一些特殊的时候，比如妖精们突然想起过往时光时，他们就会回到这里，通过聚会的方式纪念自己昔日的战友们。
控制中心并非完全漆黑，郝仁环视了一圈，发现在一些角落中竟仍然有稀少而微弱的灯光在缓缓明灭，仔细侧耳倾听的话，甚至还能听到一些细微的嗡鸣声从地板下面或者墙壁背后传来。
很显然，某些残存的备用能源线路仍然在运作着。
这就是真正的百足之虫死而不僵，作为一座以星球为基础建造起来的超级战舰，纳克达尔有着无以计数的子系统和备份模组，这些数不清的子系统可以保证哪怕星舰四分五裂，它的残骸碎块仍然可以单独“存活”，甚至单独保持一定程度的作战能力。
“导航计算机在什么地方？或者它的接口在哪？”郝仁环视了大厅一圈，没有找到明显的、可以作为中央主机的东西，于是干脆开口询问道。
“在那里！”个子最小的妖精飞到半空，抬手指着大厅上方，“那个就是！”
郝仁抬头一看，一个庞大的、几乎令人晕厥的穹顶结构让他呼吸都慢了半拍，他这才知道，原来这座大厅真正的重点是在头顶上。
只见无数巨大的合金骨架在六棱柱状大厅的顶部纵横交织，形成了仿佛巢穴般的结构，管道与线路在这些骨架之间蜿蜒交错，形成脉络，而所有这些东西最终都汇聚到一个地方，那是一个仿佛心脏般的……巨大水晶。
巨大水晶被一个牢靠的金属结构固定在穹顶上，郝仁感觉它的质感与共鸣水晶很相似，然而和正常共鸣水晶不同的是，这颗“心脏”此刻看上去黯淡无光。
这还是他第一次看到不会发光也不会与其它水晶共鸣的“共鸣水晶”，一个念头不可抑制地冒了出来：
每一块共鸣水晶都是有生命的，而大厅上方的这个水晶……它已经死去了。