来自圣主的压力是如此沉重，这些事情如果拿到外面公开，约瑟夫肯定会被裁判所以“异端”的身份处以火刑。他的信仰崩溃了，进而萌发出想要离开这个地方的迫切心理。
他从智能电脑那里得知了一些与自己相关的秘密————人类的寿命其实可以通过对细胞活化处理的方式加以改变。正常情况下，健康的人类生命极限为一百年左右。这是一个存在于理论上的极限数字，其实大多数人在九十、八十、七十，甚至六十岁就步入死亡。然而培养舱的出现使生命延长成为了可能。就像改变不良生活习惯，饮食规律，加强运动，直接效果会促使身体全面好转。只要进入培养舱，接受为期一年的休眠，就可以在电脑帮助下强化细胞活力，达到延长寿限的目的。
更重要的是，在休眠期间，智能电脑根据休眠者自身状况进行生理调节，使休眠者体能、精神、反应能力等综合数值达到最优状态。
在文明时代，这曾经是顶级富豪与权贵的专享权利。随着科技不断进化，逐渐进入了中上等级人类群体。约瑟夫很幸运，他被智能电脑默认为“残存同族”，于是相关权限下放并得以扩大，除了无法接触到核心机密，他已经成为这部分基地空间实际上的主人。
他花了大量时间研究自己掉下来的那条通道，并在智能电脑帮助下制作了一些简单的辅助器械。在休眠苏醒后一年多的时间里，约瑟夫对这些设备进行了安装，找到了一条自认为成功概率很大的逃生之路。确定了这一点，他再次进入培养舱休眠，开始了长达一年的生物调配期。
第二次苏醒，约瑟夫感觉自己精力十足，浑身上下力量充沛无比，就像重新回到最具活力的十八岁。
他离开了地下世界，凭着强健的体魄和过人技巧，攀上了悬崖，重返人世。
在地下遗迹的那段时间，约瑟夫一直在思考自己的未来和人生。圣主和所谓的神灵在他心目中早已失去了价值，他再也不会主动亲吻神圣的米字架，听见圣主之名也不会主动下跪祈祷。但这并不妨碍约瑟夫继续以教士的身份隐藏在教廷内部。他对教廷内部制度非常熟悉，直接把目光瞄准了研究部。那是专属于教廷的“科学部门”，尤其是那些颇具身份的教士研究员，他们深居简出，身边几乎没有朋友。
约瑟夫选择了其中一个叫做鲍勃的家伙，将其暗杀，成功取代。
长时间久居地下，加上充足的营养与运动，约瑟夫外貌产生了一定幅度改变。再加上他第二次进入休眠仓的时候要求智能电脑以内部调节方式对自己外观进行修整……他出现在人类世界的外表与之前相符程度约为百分之八十。
确定无人怀疑之后，他开始抛出具有分量的研究成果————米伽尔药剂。
是的，就是佩里亚斯神父研制的那种同名药剂。“米伽尔”这个药剂代号实际上是约瑟夫提出，当时并没有佩里亚斯研究成品那么显著的效果，只是一种强化型精神药剂。
约瑟夫之所以选中这种药剂作为重返教廷的突破口，是因为这种药剂有着广泛的受众。他曾经是个下级教士，知道很多神职人员在每天日课的时候都会打瞌睡，尤其是晚祷就更是感觉疲惫，却必须打起精神以应付来回监管的神父和戒律执事……这不是区区几杯浓咖啡就能解决的问题，毕竟提神饮料不可能对所有人产生效果，但经过提炼富含咖啡因的浓缩成分则不同，只需要成年人手指大小的那么一管，就能解决所有问题。更重要的是，提炼成本不算高，刚好在教廷可接受的范围内。
初代的米伽尔药剂一经推出，立刻在教廷内受到欢迎，也彻底改变了教士们在日课与晚祷时恹恹欲睡的怠惰形象。约瑟夫因此获得嘉奖，并受到时任的红衣主教和教皇接见。他充分利用了这些机会，利用自己的谈吐和不凡见识，巧妙与神学领域结合在一起，很快成为了教廷高层眼里的“优秀神职人员代表”。
接下来，就是一次次晋升，约瑟夫也顺利成为了裁判庭的副审判长。
这是他曾经担任过的职位。
约瑟夫从未想过要谋求更高的位置，他选定的目标就是副审判长。这刚好位于权力核心，有资格参与重大事务讨论，却不会被红衣主教等人视作潜在竞争对手。在中、下级教士眼中，裁判庭通常是黑色的威严形象，副审判长受人尊敬，能指挥圣教军，拥有军事实权。
三年时间过去了，约瑟夫培植起隶属于自己的庞大教士系统。他拉拢了多达数千名下级教士，尤其是神学院当年毕业的学生。他很清楚，想要拉拢那些在职者难度极大，需要付出更多的代价。刚刚步入社会的年轻人则不同，在他们看来自己已经是身份极高得大人物，一句话，甚至一个赞许的眼神，都会让他们备受鼓舞，甚至直接成为自己最强有力的拥护者和支持者。
保罗二十一世、施瓦本、黑色朗顿、红鼻子卡尔森、善良的都铎……约瑟夫侍奉过多任教皇。他从一开始就目的明确：辅导者、暗中引导、控制大部分，但绝不能成为出现在公开场合的主要人物。